Hai năm đã trôi qua kể từ khi kết thúc Đại chiến Ninja lần thứ tư. Làng Lá vẫn ở trong trạng thái hòa bình và hài hòa cho đến khi Hokage đệ lục Kakashi Hatake nhận thấy mặt trăng đang tiến gần đến Trái đất một cách nguy hiểm, gây ra nguy cơ hủy hoại hành tinh.
